工作流分享:我的文献阅读笔记流程

大家好,这里是差生文具多的热爱折腾的研究生临安。在@boninall 的鼓励下开了这篇帖子,分享一下我的文献笔记流程。因为我的整个过程都非常简单(其实也是因为技术小白),所以使用的都是基本功能,虽然用了Dataview插件,但是也只是最基础的table展示而已。

本文只展示文献查找阅读和整合知识的流程,不包括写作过程。

我的流程大体上是:查询并获取文献 → 阅读标注并做文献笔记 → 标记问题 → 整合主要观点 → 回顾并解决。下面会按照这个顺序展开叙述。

查询并获取文献

在阅读文献时我倾向于针对某个领域集中了解,从综述入手,到十分重要的标志性文献,再到与其相关的我自己比较感兴趣的文献。所以首先就是搜索并整理到自己的文献库中。搜索功能最常用的当然是Google ScholarCNKI,同时我也会使用Connected Papers,可以十分方便地看到与当前文献相关的其他文献,以及亲疏关系、权重大小等等信息。

在搜索到合适的文献后,就用浏览器插件获取到Zotero中。如果安装了油猴脚本的Sci-Hub Button脚本,那么在储存信息到Zotero的时候,很多文献的pdf会直接被下载并附到该条目上,还是比较方便的。

阅读文献做笔记及标记问题

在阅读一篇较为重要的论文时,我倾向于在笔记里反应出它原本的一些结构,方便回顾时理清思路,同时也会把比较重要的观点标出来放在最前面,这样在与其他文献进行链接时,用鼠标悬停的方式就能直接看到前两行的重要信息,比较快捷。在记笔记的过程中如果引用了其他论文中较为重要的观点,则也用[[]]先标出来,之后再补充阅读并做笔记。

在阅读论文中一定会产生疑问,或者是有看不懂的地方需要进一步查找资料,或者是对该篇文章有思考,这个时候我会提另做一个ZK笔记链接到这篇文章,按需求和内容打上不同的tag,方便之后汇总获取。

整合主要观点

只看单独的论文笔记肯定是意义不大的,需要将各种观点放在一起才比较容易了解这个方向的全貌,所以我会开一个关于这个主题的汇总笔记,把各个论文中重要的观点尽量用一句话概括后放到这里,同时链接到原论文笔记,这样可以理清思路,也为写综述创造了很多方便。

问题和想法的回顾

前面提到了单独列出来的问题笔记和思考笔记,在需要回顾时可以采用搜索的方式,比如我用#question#thoughts来标记这两种笔记,直接搜索即可,还可以搭配相关的领域tag一起搜索。另外也可以用Dataview将其列出。

经过以上的流程,在积累了一段时间的相关笔记之后就可以在图谱中查看了,通过不同的颜色和圆点的大小可以看出哪些文献相关的最多,产生的问题(红色)都和哪些论文有关,有哪些论文一直在和别的论文发生关联却没有被阅读和记录(浅灰色),又有哪些论文虽然属于这个领域却没有和其他论文产生关联,是这个领域比较孤僻没价值还是自己看得不够全面?

结语

一直以来单纯的阅读和记笔记对我来说并不是特别大的问题,使用什么方式都没关系。我在阅读文献时遇到的最大的问题其实是“如何回忆起我曾经看过某篇论文?”“这个观点好眼熟,可是它出现在哪篇文章里来着?”Obsidian对我来说主要就是解决了这个问题。本地化和markdown配合模板使记笔记的过程安心且快捷,双链功能和图谱功能方便建立笔记间的联系,标签系统加上多样化的搜索方式使笔记都能被找到,再加上Dataview插件的动态获取及展示使得维护成本非常低,基本就可以完成所有的工作了。而且非常重要的是,没有技术门槛,实现的过程没有什么负担。

对于Obsidian的高级功能我了解得不多,也许是没有需求,也许是有需求但自己并未发现,还需要不断学习。欢迎小伙伴们交流自己的高效率方法~

附:作为一个健忘症晚期患者,为了方便直达常用项目,我也设置了一个“首页”作为索引,欢迎查看关于我的工作区设置的分享帖 ๑╹◡╹)ノ”:『晒晒我的工作区』原生主题+Snippets爱好者 | 学生党

39 个赞

非常非常 有用! 对于非文献阅读也很有参考价值,可以用于个人的阅读和主题阅读中。
感谢分享! :+1:

谢谢您的回复!还在继续学习中,希望可以像Lillian一样多多输出~

学术垃圾前来学习!刚用OB才3天,决定使用它是出于Word、Excel这种形式没有办法满足我“链接思路”的需要,然后突然发现了OB这个宝藏。我建了专门用于文献笔记的库,当时有纠结是一篇文献就是一个文件,还是按ZK的理念,一个原子化观点当作一个文件,看了楼楼的分享用的方法是前者,我自己现在用的是尽量原子化(企图从中抽出写论文必要的信息)。纠结了3天,还是不太习惯原子化的理念,总是担心自己的笔记方法到最后会一团乱……期待你继续分享文献笔记方面的技巧和思路呀

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感谢回复!我觉得如果一时间不能适应新方法的话,延续原来方法也不错,毕竟做笔记的目的是为了让自己学会东西。我之前也是想学习过原子化的方式,但是我发现自己被搞得很慌乱哈哈哈哈哈,所以初步文献内容还是按篇章来的,然后重要概念提取一下。我在想或许也跟我对这个领域的知识比较熟悉有关系,如果以后学一个新领域的知识或许可以尝试一下原子化笔记,这样受之前的惯性思维影响能小一点~一起加油~

up主的文章很受益!手动点赞!

非常感谢楼主的分享!超级详细~受益匪浅~
收获了一个新的chrome插件!解决了zotero总是捕获不到pdf的问题~感恩

最近都在学习使用obsidian,想要请问一下楼主是否有较好的模板分享?如果不方便分享的话也完全没有关系~~~非常非常感谢(●’◡’●)能发现这篇文章真好

谢谢分享!可惜很多还看不懂,请问有哪里有帮助可以详细一步一步了解下OB的所有功能?我感觉自己还没利用好,目前只用同步、笔记、[[]],双链是什么?

不好意思这段时间没怎么上论坛【捂脸
模板的话我好像没什么特别的,就是很普通的笔记形式,感觉这个主要还是看自己的需求。可以在论坛或者B站看看大家的工作流分享,或许能有好的灵感~

可以在论坛找一下新手入门类的教程,有的大佬写得特别详细~

感恩,一直在思索ob怎么和其他软件结合,放在自己的科研工作流里发挥他的作用。楼楼的帖子给我了启发~

想请教下,这里的dataview的代码是什么呀

你好,我想问问你这个笔记正文里面引用文献的时候,比如“荣蓉2013”是怎么让它这么显示的呢?我引用的时候他显示的是文件的链接,文件的位置目录都显示出来了,一大串,我也不知道咋改了。链接zotero我用的是bibnotes和bibTex

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写的挺好的,学习了,我和你的思路差不多,我也用zotero管理文献,用CItation 导入至OB(此时已经导入了标题,doi,摘要,笔记等信息),自己最后在后面加一个Summarry的标题来提炼学习到的知识点。同时也用Dataview按课题分别列出来。同时我也将自己的实验记录写在OB上方便回顾查找,我的可能对理工科需要做实验的同学有帮助,有空了我也分享下自己的工作流。

咱们的工作流估计都差不多