受到作者的启发，谈一点个人的思考：
- root和father其实就是我们习惯使用的文件夹结构，将文件归类到文件夹更符合习惯，而且假如需要改变root或father时，更改目录和打开文件修改链接比，显然更灵活也更便捷。当然，如果有个插件可以把根据文件夹的变化自动修改root和和father，那文件中保留这两个链接在阅读时会更方便。
- related是在写作中自然运用的，起到了类似于词典和来源的作用，根据需要和已有卡片化内容进行丰富。
- sibling是前后文和同级目录的关系，是比较密切或有系统关联的一组文件。
- 标签可以作为和文章内容无关的分类，如完成状态、用途等
基于上述认识，个人觉得简单的组织原则就是：文件夹按内容而不是按用途分类，需要用途、状态的用标签；文章内只保留related和sibling两种链接，写作过程中不强求用related关联，想到就用，想不到也不强求，就像不能为了有学问就处处用成语一样；因为要让知识尽量原子化，以便于和其它知识点关联（就像我们的成语词典），sibling则是基于某种形式或关系把成语故事链接起来，它们可能是时间线的关系，如历史，也可能是一组小故事，如为了教育你要努力学习而编写的“凿壁偷光”、“头悬梁、锥刺股”。