我是从ZK接入PARA的，PARA尽可能轻量并且只管理项目用。
然后PARA中的渐进归纳的流程我给舍弃掉了，只在ZK知识沉淀那边进行渐进归纳。所以就成了：P-管理项目，A-输出内容（相当于传统笔记文件夹+一些checklist之类的），R-原文存档（包含剪藏内容、文献原文等）A-存档项目
所以这个流程相当于限制了PAR之间的流转，尽可能轻量化，应该是很少会有你提到的这些问题，项目驱动+轻分类+重产出，例如A-输出内容里面的编程领域，输出完就可以一键同步到公众号或者其他博客平台。我这个倒是没有inbox，被ZK中的闪念笔记替代了
更详细的可以参考下我这篇： 结合 PARA 和 Zettelkasten 的工作流分享 - 经验分享 - Obsidian 中文论坛
不过… 这种结合我也是进行没多久目前感觉一切还ok，对你来说还得额外引入ZK… 所以还是仅供参考 