如何根据文件夹层级关系生成永久的目录和链接?

有一个叫做file index 的插件,可以自动根据整个文件夹生成目录索引,并且形成关系图谱,但这个插件是实时更新的,生成的目录和链接也不是永久的,停用插件之后就自动消失了,另一个叫做zoottelkeeper的插件生成的目录和链接是永久的,但是会在开头和结尾自动形成
%% Zoottelkeeper: Beginning of the autogenerated index file list %%
%% Zoottelkeeper: End of the autogenerated index file list %%
两段标记,而且貌似无法取消这项功能